Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Thbs2Q03350 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms