Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms