Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp30Q3UN04 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms