Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gbx1P82976 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gbx1P82976 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gbx1P82976 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gbx1P82976 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gbx1P82976 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gbx1P82976 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gbx1P82976 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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