Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Cdkn1bP46414 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms