Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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BC024978J3QPC3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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BC024978J3QPC3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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BC024978J3QPC3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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BC024978J3QPC3 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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BC024978J3QPC3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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BC024978J3QPC3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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