Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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