Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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