Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxraP28700 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxraP28700 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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