Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms