Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gramd1b-203ENSMUST00000119373 3857 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm20743-202ENSMUST00000194322 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cd22-202ENSMUST00000108125 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ano4-204ENSMUST00000182341 3959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cdc5l-201ENSMUST00000024727 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm31024-201ENSMUST00000207600 2353 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Cdc25b-202ENSMUST00000079857 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rint1-201ENSMUST00000030852 3298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms