Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CartptP56388 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CartptP56388 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CartptP56388 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CartptP56388 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms