Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hdac5Q9Z2V6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hdac5Q9Z2V6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms