Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psma1Q9R1P4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma1Q9R1P4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms