Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF3Q9NR81 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF3Q9NR81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms