Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LitafQ9JLJ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LitafQ9JLJ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms