Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uchl3Q9JKB1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uchl3Q9JKB1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.4 ms