Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms