Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
March8Q9DBD2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
March8Q9DBD2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
March8Q9DBD2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
March8Q9DBD2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
March8Q9DBD2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
March8Q9DBD2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
March8Q9DBD2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms