Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Derl3Q9D8K3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Derl3Q9D8K3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms