Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nrxn1Q9CS84 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nrxn1Q9CS84 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nrxn1Q9CS84 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms