Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gdpd1Q9CRY7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Gdpd1Q9CRY7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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Gdpd1Q9CRY7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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Gdpd1Q9CRY7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Gdpd1Q9CRY7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Gdpd1Q9CRY7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdpd1Q9CRY7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Gdpd1Q9CRY7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Gdpd1Q9CRY7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Gdpd1Q9CRY7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gdpd1Q9CRY7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Gdpd1Q9CRY7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdpd1Q9CRY7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gdpd1Q9CRY7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms