Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed6Q9CQG0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed6Q9CQG0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms