Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED2Q9BTP6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED2Q9BTP6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms