Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RetnQ99P87 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RetnQ99P87 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms