Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp1b1Q99LU0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Chmp1b1Q99LU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Chmp1b1Q99LU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms