Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPDL1Q96EA4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPDL1Q96EA4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms