Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2FQ969M7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2FQ969M7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms