Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb6Q922F4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb6Q922F4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms