Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfxapQ8VCG9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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