Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nup35Q8R4R6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms