Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms