Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mcfd2Q8K5B2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mcfd2Q8K5B2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms