Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20aQ8CID3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20aQ8CID3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms