Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CrebrfQ8CDG5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CrebrfQ8CDG5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrebrfQ8CDG5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms