Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp20Q8C6M1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp20Q8C6M1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp20Q8C6M1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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