Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf653Q6YND2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf653Q6YND2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms