Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CtifQ6PEE2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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