Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l2Q6KAU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms