Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SypQ62277 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SypQ62277 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SypQ62277 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SypQ62277 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SypQ62277 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SypQ62277 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SypQ62277 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SypQ62277 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SypQ62277 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SypQ62277 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SypQ62277 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SypQ62277 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SypQ62277 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SypQ62277 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SypQ62277 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SypQ62277 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms