Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2bQ61313 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tfap2bQ61313 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms