Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vdac1Q60932 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vdac1Q60932 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms