Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha1Q60750 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha1Q60750 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms