Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hhla1Q3TYV2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hhla1Q3TYV2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hhla1Q3TYV2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms