Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1rd19Q3KNP5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1rd19Q3KNP5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
V1rd19Q3KNP5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
V1rd19Q3KNP5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms