Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB30Q15771 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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