Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 TFC7YOR110W 1308 nt4.8□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 CWC2YDL209C 1020 nt4.8□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.8□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 TRE1YPL176C 2352 nt4.79□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 ECM32YER176W 3366 nt4.79□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 ACT1YFL039C 1128 nt4.79□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 NAT5YOR253W 531 nt4.79□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 RVB1YDR190C 1392 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 FRS1YLR060W 1788 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 TDA11YHR159W 1515 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 CDC10YCR002C 969 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 KIN28YDL108W 921 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 YDL228CYDL228C 642 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 API2YDR525W 330 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 BUD25YER014C-A 462 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 MIC26YGR235C 702 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 DCD1YHR144C 939 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 TIF34YMR146C 1044 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 YPL162CYPL162C 822 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 YCL012CYCL012C 405 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 PHO87YCR037C 2772 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 STB2YMR053C 2553 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 FLC1YPL221W 2382 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 KRE29YER038C 1395 nt4.78□□□□□ -1.64
TY3A-GQ12173 MSK1YNL073W 1731 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 CRT10YOL063C 2874 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 TPO2YGR138C 1845 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 AIP1YMR092C 1848 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 LHP1YDL051W 828 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YDR445CYDR445C 408 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YER084WYER084W 387 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 LSO1YJR005C-A 282 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 PRP40YKL012W 1752 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 RIA1YNL163C 3333 nt4.77□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 NNK1YKL171W 2787 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 MET17YLR303W 1335 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 CWH43YCR017C 2862 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 DIT1YDR403W 1611 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SUR2YDR297W 1050 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 IRC22YEL001C 678 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 CNN1YFR046C 1086 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 NPY1YGL067W 1155 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SPC105YGL093W 2754 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YJR038CYJR038C 363 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 OPY2YPR075C 1083 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 KRE6YPR159W 2163 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SKM1YOL113W 1968 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 MNT2YGL257C 1677 nt4.76□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 MSE1YOL033W 1611 nt4.75□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 HIS4YCL030C 2400 nt4.75□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 EAF5YEL018W 840 nt4.75□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 RMR1YGL250W 726 nt4.75□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YKL023WYKL023W 834 nt4.75□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.75□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 HRK1YOR267C 2280 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SEG2YKL105C 3399 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 RAD28YDR030C 1521 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 NUP42YDR192C 1293 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 ARC1YGL105W 1131 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 PAU17YLL025W 375 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 OSW5YMR148W 447 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 MEF2YJL102W 2460 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 PGM2YMR105C 1710 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 LDB17YDL146W 1476 nt4.74□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 PEX29YDR479C 1665 nt4.73□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YDL032WYDL032W 312 nt4.73□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 TRM8YDL201W 861 nt4.73□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 TEF4YKL081W 1239 nt4.73□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 VPS68YOL129W 555 nt4.73□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SKG3YLR187W 3081 nt4.73□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SFI1YLL003W 2841 nt4.73□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SBE2YDR351W 2595 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YDR161WYDR161W 1164 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YDR282CYDR282C 1245 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 ZRT1YGL255W 1131 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YGR016WYGR016W 573 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 NTR2YKR022C 969 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YLR125WYLR125W 411 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YOR131CYOR131C 657 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 SSL1YLR005W 1386 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YGR125WYGR125W 3111 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 YMR221CYMR221C 1515 nt4.72□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 ARO80YDR421W 2853 nt4.71□□□□□ -1.65
TY3A-GQ12173 BNS1YGR230W 414 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 HLJ1YMR161W 675 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 COG5YNL051W 1212 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 RFA2YNL312W 822 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 TAF5YBR198C 2397 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 JHD2YJR119C 2187 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 SAC1YKL212W 1872 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 TRM11YOL124C 1302 nt4.71□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 IBA57YJR122W 1494 nt4.7□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 ARP10YDR106W 855 nt4.7□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.7□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 DAM1YGR113W 1032 nt4.7□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 YGR269WYGR269W 327 nt4.7□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 MET16YPR167C 786 nt4.7□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 MRS2YOR334W 1413 nt4.7□□□□□ -1.66
TY3A-GQ12173 LAP2YNL045W 2016 nt4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.4 ms