Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc162pQ0VG85 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc162pQ0VG85 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms