Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shisal1Q0VBP7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shisal1Q0VBP7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shisal1Q0VBP7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms