Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kndc1Q0KK55 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kndc1Q0KK55 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kndc1Q0KK55 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms